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π集群助力生命科学院韦朝春教授Nature发文

时间:2018-05-08 阅读: 我要纠错

        2018年4月25日,《自然》期刊以长文形式发表了联合国际水稻研究所(IRRI)、上海交通大学等16家单位共同完成的“Genomic variation in 3,010 diverse accessions of Asian cultivated rice”。 上海交通大学生命科学技术学院韦朝春教授为共同通讯作者。本次项目得到了上海大学π超算的大力支持。


        本项研究收集了3000多份水稻品种,对核心水稻品种的基因组遗传多样性,对水稻的起源、基因、分类和进化规律进行了分析。对大规模水稻基因的发掘和水稻复杂性状分子改良技术瓶颈的突破将产生极大促进作用。
        要对如此繁多的水稻品种进行研究需要用到大量的科学运算,特别是对于基因的分析,π集群的强大并行运算能力作为强有力的科研支撑,帮助韦朝春老师的课题组极大地缩短了本次研究的计算时间。计算中心一直秉持着服务于用户的理念,为韦朝春教授团队一一解决了在π集群上所遇到的问题,超算用户在Nature这样的高水平期刊上发文是对中心服务最大的肯定。


 

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